Vzdělávání žáků se speciálními vzdělávacími potřebami upravuje zákon č.561/2004 Sb., o předškolním, základním, středním, vyšším odborném a jiném vzdělávání (školský zákon), ve znění pozdějších předpisů (§16, §40 a §48) a vyhláška č.73/2005 Sb., o vzdělávání dětí, žáků a studentů se speciálními vzdělávacími potřebami a dětí, žáků a studentů mimořádně nadaných.
Individuální integrace: škola vypracuje IVP na základě doporučení školského poradenského zařízení. V případě, že školské poradenské zařízení doporučí vzdělávání podle upraveného vzdělávacího programu, musí být IVP zpracován pro všechny předměty podle tohoto programu, v opačném případě je IVP zpracován jen pro některé vyučovací předměty dle individuálních potřeb žáka. Žák se smyslovým, tělesným postižením nebo vadami řeči a vývojovými poruchami učení nebo chování je vzděláván podle IVP, který vychází z ŠVP dané školy, předpokladem je zajištění vhodných podmínek vzdělávání a podpůrných opatření. Naproti tomu u žáků s lehkým mentálním postižením vychází IVP z rámcového vzdělávacího programu pro základní vzdělávání.
Skupinová integrace: může být realizována zřízením třídy nebo oddělením či studijní skupinou ve třídě. Pro třídu, oddělení či skupinu zřízenou pro žáky se smyslovým, tělesným postižením nebo vadami řeči a s vývojovými poruchami učení a/nebo chování vypracuje škola samostatný ŠVP s úpravami podle kapitoly č. 8 RVP ZV, formou přílohy ke stávajícímu ŠVP. Pro třídu, skupinu či oddělení zřízené pro žáky s lehkým mentálním postižením škola vypracuje ŠVP podle RVP ZV – LMP, formou přílohy ke stávajícímu ŠVP. Pro třídu, skupinu či oddělení žáků se středně těžkým a těžkým mentálním postižením, žáků se souběžným postižením více vadami a žáků s autismem škola vypracuje ŠVP dle rámcového vzdělávacího programu pro základní školy speciální (RVP ZŠS), formou přílohy ke stávajícímu ŠVP.
V případě skupinové integrace žáků se zdravotním postižením škola zpracuje samostatný školní vzdělávací program formou přílohy ke stávajícímu ŠVP; příloha bude mít strukturu ŠVP, ale nebudou v ní uvedeny ty části, které by kopírovaly stávající ŠVP.