Školní knihovna je samostatný ucelený modul školského informačního systému Škola OnLine. Výhodou integrace školní knihovny do školského informačního systému je těsné provázání s dalšími agendami, jako je školní matrika či evidence učitelů.

Modul umožňuje evidovat několik druhů knihoven, přičemž každá může být určena jinému okruhu čtenářů (žákovská knihovna, učitelská knihovna,...). Školní knihovna podporuje evidenci různích knihovnických jednotek, přičemž v knihovně může být zařazeno i více exemplářů k jedné jednotce. Knihy je možné kategorizovat dle pravidel pro vytváření knihovních katalogů.

Učitelům a žákům je k dispozici funkčnost pro prohledávání školní knihovny. Nedostupnou knihu je možné též jednoduše rezervovat a následně si ji pouze jednoduše vyzvednout ve školní knihovně. S blížícím se termínem konce výpůjčky je pak možné čtenářům automaticky rozesílat upozornění e-mailem.