Úložiště dokumentů je modulem, který škole umožní snadno vkládat nejrůznější soubory do aplikace Škola OnLine a ty následně sdílet například s učitelským sborem, nebo s žáky a jejich zákonnými zástupci. Modul disponuje snadnou tvorbou souborového systému z pohledu složek a jejich podložek, u kterých administrátor aplikace nastavuje oprávnění pro jednotlivé role uživatelů v aplikaci Škola OnLine. Díky tomuto modulu škola získá sdílený datový prostor, který je dostupný všem uživatelům aplikace a to jak z pohledu stahování souborů z úložiště, tak z pohledu nahrávání souborů do úložiště.